持有商铺需要交纳的税种包括：
契税：
买入合同金额的3%。
印花税：
买卖交易价格的0.05%。
房产税：
持有环节应缴税，包括共有房产税和土地使用税两种。
土地增值税：
在出售商铺时需要缴纳，通常是全额的5%。
个人所得税：
出售商铺时，卖家需要缴纳个人所得税，可能是全额的1.5%或差额的20%。
增值税：
个人出租商铺需要缴纳增值税，根据月销售额的不同，税率从0%到5%不等。
城市维护建设税 、 教育附加和 地方教育附加：
根据实际缴纳的增值税税额计算，具体税率根据地区政策而定。
交易手续费：
房地产交易手续费，普通住宅5元/平方米，非普通住宅11元/平方米。
登记费：
房屋登记费，具体金额根据地区和具体情况而定。
建议在购买或出售商铺前，详细咨询当地税务部门或专业税务顾问，以确保准确了解和遵守相关税收政策。
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