南京扣分违章的处理方式有以下几种：
前往车管所或交警大队窗口处理
可以选择去车辆所在地的交警队或者车管所窗口进行处理，也可以选择去违章发生地的交警队处理。
使用交管12123 APP自助处理
如果您的驾驶证和车辆已经进行了绑定，可以通过手机使用交管12123 APP自助处理违章。
使用自助处理机处理
许多自助处理机也可以自助处理违章，但需要有一定的分数才能使用这些机器。
到违章发生地的交警队处理
车主需要携带驾照和行驶本去违章地任何一个交警队或行政综合处理大厅可以接受处理。
通过网上银行或电话银行处理
持有工行卡并已开通网银功能的用户，可以通过工行的网上银行、电话银行、各网点自助终端或短信银行等自助方式处理交通违法曝光。
到指定银行缴纳罚款
处理违章后，需要拿着处罚决定书到指定的银行交罚款。处罚决定书一旦打印完毕，必须在15日内交罚款，超过15天的，每天收取3%的滞纳金。
通过邮政代办
可以通过邮政代办，客服热线11185；通过12580热线代办；通过公安交警信息网办理等方式处理交通违章扣分。
建议选择最方便的方式进行处理，例如使用交管12123 APP或自助处理机，可以节省时间和精力。如果有扣分，建议先确认违章和扣除分数后再缴纳罚款，以确保处理过程顺畅。
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